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　　2009 年起，施一公开始在清华大学推动人才培养与管理体制的改革。他主张建立更灵活的人才评价机制，打破传统科研评价中的 “唯论文” 倾向，注重科研成果的实际价值与人才的长期发展。在他的推动下，清华生命科学学院引入了一批国际顶尖的青年学者，形成了富有活力的科研氛围。此后十年间，他带领团队在结构生物学领域取得多项国际级突破 —— 比如在剪接体结构研究中，首次解析出高分辨率的剪接体三维结构，为理解基因表达调控机制提供了关键依据。这些成果让中国在该领域的研究跻身世界前列，而施一公也凭借突出的贡献，逐步晋升至清华副校长的职位。

　　质疑声中，更受关注的是 200 亿办学资金的来源。与传统公办高校依赖政府拨款不同，西湖大学的资金完全来自社会各界的自愿捐赠。为筹集这笔资金，施一公几乎放下了所有科研工作，四处奔走。他先后与多位企业家、慈善人士沟通，阐述西湖大学的办学理念 —— 以生命科学、理学、工学为核心，聚焦前沿基础研究与应用技术突破，培养能解决人类面临的重大科技问题的人才。最终，包括王健林、马化腾在内的多位业界人士及企业伸出援手，逐步凑齐了初期办学所需的资金，让这所 “理想中的大学” 得以落地。

　　2018 年，西湖大学正式获批成立，成为中国第一所由社会力量举办、国家重点支持的新型研究型大学。成立初期，施一公便确立了独特的办学方向：仅招收研究生，不开展本科教育。这一决策的初衷，是希望集中资源培养高层次科研人才，避免分散精力在基础学科的普及上。同时，学校还制定了严格的师资聘用标准 —— 所有教授必须全职在岗，不得在其他机构兼职或从事副业，确保教师能将全部精力投入教学与科研。为组建顶尖师资团队，施一公曾多次亲自飞往美国、欧洲等地，与当地知名高校的科学家沟通，凭借办学理念与科研平台的吸引力，说服多位国际顶尖学者放弃海外优厚待遇，全职加入西湖大学。

　　在招生方面，西湖大学初期的 “只招研究生” 模式持续了四年。2022 年，学校首次启动本科生招生，但其招生规模与标准依旧严苛 —— 当年仅计划招收 60 名本科生，通过 “综合素质评价 + 高考” 的方式选拔。最终录取的学生，高考分数均达到所在省份的顶尖水平，与清华、北大的录取分数线基本持平。这些本科生入学后，将采用 “导师制” 培养模式，每位学生配备一名顶尖教授作为学术导师，从大一开始便参与科研项目，提前接触前沿学术领域。